Bioinformatika laboratórium: Molekuláris méréstechnikától az orvosi döntéstámogatásig
A bioinformatikai laboratórium jegyzetei (laborsillabuszai) a gyorsan fejlődő
bioinformatika új kihívásai mentén haladnak, támaszkodva a Bioinformatika
jegyzet megfelelő fejezeteiben található elméleti összefoglalókra és a
virtuálislabor-koncepcióban kidolgozott eszközökre. Az első fejezet a biobankok
és laboratóriumi információs rendszerek világát mutatja be. Ezt követően a
genetikai méréstechnikák eszközeit foglalja össze két fejezet. A kísérlettervezést,
különösen a többlépcsős és nagy mennyiségű, heterogén adat és tudás fúzióján
alapuló kísérlettervezést mutatja be a következő fejezet. Az adatok hatékony
megosztása és a nagy számításigény miatt egyre fontosabbá válnak az általánosan
elérhető, közmű jellegű informatikai szolgáltatások, amelyek működését tekinti
át a következő fejezet. A genetikai és génexpressziós adatok standard elemzését
egy-egy fejezet ismerteti, amit egy rendszerbiológiai ihletésű többváltozós
biomarker-elemzési módszertan bemutatása és egy Bayes-i oksági következtetési
metodológia áttekintése követ. A biomarkerek felhasználását döntéstámogató
rendszerek építése és adaptív döntéstámogató rendszerek létrehozása kapcsán is
bemutatjuk egy-egy fejezetben. Az utolsó két sillabusz egy gyógyszerkutatási megközelítést
és egy metagenomika elemzési munkafolyamatot foglal össze.